Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI04

Cog3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, mousemouse

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Length 820 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cog3Q8CI04 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cog3Q8CI04 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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Cog3Q8CI04 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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Cog3Q8CI04 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Cog3Q8CI04 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cog3Q8CI04 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cog3Q8CI04 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Cog3Q8CI04 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cog3Q8CI04 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cog3Q8CI04 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cog3Q8CI04 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cog3Q8CI04 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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Cog3Q8CI04 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cog3Q8CI04 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cog3Q8CI04 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cog3Q8CI04 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cog3Q8CI04 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cog3Q8CI04 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cog3Q8CI04 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cog3Q8CI04 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms