Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC6

Rbm28, RNA-binding protein 28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm28Q8CGC6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbm28Q8CGC6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbm28Q8CGC6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbm28Q8CGC6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbm28Q8CGC6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbm28Q8CGC6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbm28Q8CGC6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbm28Q8CGC6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbm28Q8CGC6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbm28Q8CGC6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbm28Q8CGC6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbm28Q8CGC6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbm28Q8CGC6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbm28Q8CGC6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbm28Q8CGC6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbm28Q8CGC6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbm28Q8CGC6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbm28Q8CGC6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbm28Q8CGC6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbm28Q8CGC6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbm28Q8CGC6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbm28Q8CGC6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbm28Q8CGC6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbm28Q8CGC6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbm28Q8CGC6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbm28Q8CGC6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbm28Q8CGC6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbm28Q8CGC6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbm28Q8CGC6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbm28Q8CGC6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbm28Q8CGC6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbm28Q8CGC6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbm28Q8CGC6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbm28Q8CGC6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbm28Q8CGC6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbm28Q8CGC6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbm28Q8CGC6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbm28Q8CGC6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbm28Q8CGC6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbm28Q8CGC6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbm28Q8CGC6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbm28Q8CGC6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbm28Q8CGC6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbm28Q8CGC6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbm28Q8CGC6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbm28Q8CGC6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbm28Q8CGC6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbm28Q8CGC6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbm28Q8CGC6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbm28Q8CGC6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbm28Q8CGC6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbm28Q8CGC6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbm28Q8CGC6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbm28Q8CGC6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbm28Q8CGC6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbm28Q8CGC6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbm28Q8CGC6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbm28Q8CGC6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbm28Q8CGC6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbm28Q8CGC6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbm28Q8CGC6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rbm28Q8CGC6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rbm28Q8CGC6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rbm28Q8CGC6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbm28Q8CGC6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms