Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Hpf1Q8CFE2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hpf1Q8CFE2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hpf1Q8CFE2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hpf1Q8CFE2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hpf1Q8CFE2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hpf1Q8CFE2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hpf1Q8CFE2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Hpf1Q8CFE2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hpf1Q8CFE2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hpf1Q8CFE2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hpf1Q8CFE2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Hpf1Q8CFE2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hpf1Q8CFE2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hpf1Q8CFE2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hpf1Q8CFE2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hpf1Q8CFE2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hpf1Q8CFE2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hpf1Q8CFE2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hpf1Q8CFE2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms