Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp27Q8CEG8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp27Q8CEG8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp27Q8CEG8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp27Q8CEG8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp27Q8CEG8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp27Q8CEG8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp27Q8CEG8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp27Q8CEG8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp27Q8CEG8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp27Q8CEG8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp27Q8CEG8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp27Q8CEG8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp27Q8CEG8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp27Q8CEG8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp27Q8CEG8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms