Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE20

9030612E09Rik, RIKEN cDNA 9030612E09, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9030612E09RikQ8CE20 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
9030612E09RikQ8CE20 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
9030612E09RikQ8CE20 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
9030612E09RikQ8CE20 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
9030612E09RikQ8CE20 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
9030612E09RikQ8CE20 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
9030612E09RikQ8CE20 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
9030612E09RikQ8CE20 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
9030612E09RikQ8CE20 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
9030612E09RikQ8CE20 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
9030612E09RikQ8CE20 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
9030612E09RikQ8CE20 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
9030612E09RikQ8CE20 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
9030612E09RikQ8CE20 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
9030612E09RikQ8CE20 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
9030612E09RikQ8CE20 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
9030612E09RikQ8CE20 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
9030612E09RikQ8CE20 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
9030612E09RikQ8CE20 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
9030612E09RikQ8CE20 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
9030612E09RikQ8CE20 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
9030612E09RikQ8CE20 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
9030612E09RikQ8CE20 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
9030612E09RikQ8CE20 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
9030612E09RikQ8CE20 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
9030612E09RikQ8CE20 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
9030612E09RikQ8CE20 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
9030612E09RikQ8CE20 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
9030612E09RikQ8CE20 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
9030612E09RikQ8CE20 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
9030612E09RikQ8CE20 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
9030612E09RikQ8CE20 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
9030612E09RikQ8CE20 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
9030612E09RikQ8CE20 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
9030612E09RikQ8CE20 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
9030612E09RikQ8CE20 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
9030612E09RikQ8CE20 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
9030612E09RikQ8CE20 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
9030612E09RikQ8CE20 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
9030612E09RikQ8CE20 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
9030612E09RikQ8CE20 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
9030612E09RikQ8CE20 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
9030612E09RikQ8CE20 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
9030612E09RikQ8CE20 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
9030612E09RikQ8CE20 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
9030612E09RikQ8CE20 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
9030612E09RikQ8CE20 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
9030612E09RikQ8CE20 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
9030612E09RikQ8CE20 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
9030612E09RikQ8CE20 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
9030612E09RikQ8CE20 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
9030612E09RikQ8CE20 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
9030612E09RikQ8CE20 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
9030612E09RikQ8CE20 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
9030612E09RikQ8CE20 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
9030612E09RikQ8CE20 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
9030612E09RikQ8CE20 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
9030612E09RikQ8CE20 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
9030612E09RikQ8CE20 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
9030612E09RikQ8CE20 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
9030612E09RikQ8CE20 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
9030612E09RikQ8CE20 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
9030612E09RikQ8CE20 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
9030612E09RikQ8CE20 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
9030612E09RikQ8CE20 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
9030612E09RikQ8CE20 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
9030612E09RikQ8CE20 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
9030612E09RikQ8CE20 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
9030612E09RikQ8CE20 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
9030612E09RikQ8CE20 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
9030612E09RikQ8CE20 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
9030612E09RikQ8CE20 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
9030612E09RikQ8CE20 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.08■□□□□ 0
9030612E09RikQ8CE20 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
9030612E09RikQ8CE20 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
9030612E09RikQ8CE20 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
9030612E09RikQ8CE20 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
9030612E09RikQ8CE20 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
9030612E09RikQ8CE20 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.07■□□□□ 0
9030612E09RikQ8CE20 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
9030612E09RikQ8CE20 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
9030612E09RikQ8CE20 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
9030612E09RikQ8CE20 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
9030612E09RikQ8CE20 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
9030612E09RikQ8CE20 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.07■□□□□ 0
9030612E09RikQ8CE20 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
9030612E09RikQ8CE20 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
9030612E09RikQ8CE20 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.07■□□□□ 0
9030612E09RikQ8CE20 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
9030612E09RikQ8CE20 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
9030612E09RikQ8CE20 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
9030612E09RikQ8CE20 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
9030612E09RikQ8CE20 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
9030612E09RikQ8CE20 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
9030612E09RikQ8CE20 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
9030612E09RikQ8CE20 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
9030612E09RikQ8CE20 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
9030612E09RikQ8CE20 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
9030612E09RikQ8CE20 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
9030612E09RikQ8CE20 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms