Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc63Q8CDV6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc63Q8CDV6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc63Q8CDV6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc63Q8CDV6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc63Q8CDV6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc63Q8CDV6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc63Q8CDV6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc63Q8CDV6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc63Q8CDV6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc63Q8CDV6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc63Q8CDV6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc63Q8CDV6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc63Q8CDV6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc63Q8CDV6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc63Q8CDV6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc63Q8CDV6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc63Q8CDV6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc63Q8CDV6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc63Q8CDV6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc63Q8CDV6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc63Q8CDV6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc63Q8CDV6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc63Q8CDV6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc63Q8CDV6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc63Q8CDV6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc63Q8CDV6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc63Q8CDV6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc63Q8CDV6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc63Q8CDV6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc63Q8CDV6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc63Q8CDV6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc63Q8CDV6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc63Q8CDV6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc63Q8CDV6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc63Q8CDV6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc63Q8CDV6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc63Q8CDV6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc63Q8CDV6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc63Q8CDV6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc63Q8CDV6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc63Q8CDV6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc63Q8CDV6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc63Q8CDV6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc63Q8CDV6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc63Q8CDV6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc63Q8CDV6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc63Q8CDV6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc63Q8CDV6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc63Q8CDV6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc63Q8CDV6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc63Q8CDV6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc63Q8CDV6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc63Q8CDV6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc63Q8CDV6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc63Q8CDV6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc63Q8CDV6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc63Q8CDV6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc63Q8CDV6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc63Q8CDV6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc63Q8CDV6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc63Q8CDV6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc63Q8CDV6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc63Q8CDV6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc63Q8CDV6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc63Q8CDV6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc63Q8CDV6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc63Q8CDV6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc63Q8CDV6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc63Q8CDV6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc63Q8CDV6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc63Q8CDV6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc63Q8CDV6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc63Q8CDV6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc63Q8CDV6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc63Q8CDV6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc63Q8CDV6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc63Q8CDV6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc63Q8CDV6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc63Q8CDV6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc63Q8CDV6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc63Q8CDV6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc63Q8CDV6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc63Q8CDV6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc63Q8CDV6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc63Q8CDV6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc63Q8CDV6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc63Q8CDV6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc63Q8CDV6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc63Q8CDV6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc63Q8CDV6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc63Q8CDV6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc63Q8CDV6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc63Q8CDV6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc63Q8CDV6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc63Q8CDV6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc63Q8CDV6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc63Q8CDV6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc63Q8CDV6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc63Q8CDV6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms