Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc178Q8CDV0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc178Q8CDV0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc178Q8CDV0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc178Q8CDV0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc178Q8CDV0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc178Q8CDV0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc178Q8CDV0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc178Q8CDV0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc178Q8CDV0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc178Q8CDV0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc178Q8CDV0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc178Q8CDV0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc178Q8CDV0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc178Q8CDV0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc178Q8CDV0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc178Q8CDV0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc178Q8CDV0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc178Q8CDV0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc178Q8CDV0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc178Q8CDV0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc178Q8CDV0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc178Q8CDV0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc178Q8CDV0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc178Q8CDV0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc178Q8CDV0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc178Q8CDV0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc178Q8CDV0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ccdc178Q8CDV0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc178Q8CDV0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc178Q8CDV0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc178Q8CDV0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc178Q8CDV0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc178Q8CDV0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc178Q8CDV0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc178Q8CDV0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc178Q8CDV0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc178Q8CDV0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc178Q8CDV0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc178Q8CDV0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc178Q8CDV0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc178Q8CDV0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc178Q8CDV0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc178Q8CDV0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc178Q8CDV0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc178Q8CDV0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc178Q8CDV0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc178Q8CDV0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc178Q8CDV0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc178Q8CDV0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc178Q8CDV0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc178Q8CDV0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc178Q8CDV0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc178Q8CDV0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc178Q8CDV0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc178Q8CDV0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc178Q8CDV0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc178Q8CDV0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc178Q8CDV0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc178Q8CDV0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc178Q8CDV0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc178Q8CDV0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc178Q8CDV0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc178Q8CDV0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc178Q8CDV0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc178Q8CDV0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc178Q8CDV0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc178Q8CDV0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc178Q8CDV0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc178Q8CDV0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc178Q8CDV0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc178Q8CDV0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc178Q8CDV0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc178Q8CDV0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc178Q8CDV0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc178Q8CDV0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc178Q8CDV0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc178Q8CDV0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc178Q8CDV0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc178Q8CDV0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc178Q8CDV0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc178Q8CDV0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc178Q8CDV0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc178Q8CDV0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc178Q8CDV0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc178Q8CDV0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc178Q8CDV0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc178Q8CDV0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc178Q8CDV0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc178Q8CDV0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc178Q8CDV0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc178Q8CDV0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc178Q8CDV0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc178Q8CDV0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc178Q8CDV0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc178Q8CDV0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc178Q8CDV0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc178Q8CDV0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc178Q8CDV0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc178Q8CDV0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms