Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Lrrc9Q8CDN9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Lrrc9Q8CDN9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Lrrc9Q8CDN9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Lrrc9Q8CDN9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Lrrc9Q8CDN9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Lrrc9Q8CDN9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Lrrc9Q8CDN9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Lrrc9Q8CDN9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Lrrc9Q8CDN9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Lrrc9Q8CDN9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Lrrc9Q8CDN9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Lrrc9Q8CDN9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Lrrc9Q8CDN9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Lrrc9Q8CDN9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Lrrc9Q8CDN9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Lrrc9Q8CDN9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Lrrc9Q8CDN9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Lrrc9Q8CDN9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Lrrc9Q8CDN9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Lrrc9Q8CDN9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lrrc9Q8CDN9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lrrc9Q8CDN9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lrrc9Q8CDN9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lrrc9Q8CDN9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lrrc9Q8CDN9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Lrrc9Q8CDN9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Lrrc9Q8CDN9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Lrrc9Q8CDN9 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Lrrc9Q8CDN9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Lrrc9Q8CDN9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Lrrc9Q8CDN9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Lrrc9Q8CDN9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Lrrc9Q8CDN9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Lrrc9Q8CDN9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Lrrc9Q8CDN9 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Lrrc9Q8CDN9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Lrrc9Q8CDN9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Lrrc9Q8CDN9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lrrc9Q8CDN9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lrrc9Q8CDN9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lrrc9Q8CDN9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lrrc9Q8CDN9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lrrc9Q8CDN9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lrrc9Q8CDN9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Lrrc9Q8CDN9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lrrc9Q8CDN9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Lrrc9Q8CDN9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Lrrc9Q8CDN9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Lrrc9Q8CDN9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Lrrc9Q8CDN9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Lrrc9Q8CDN9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lrrc9Q8CDN9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lrrc9Q8CDN9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lrrc9Q8CDN9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lrrc9Q8CDN9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lrrc9Q8CDN9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lrrc9Q8CDN9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Lrrc9Q8CDN9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Lrrc9Q8CDN9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lrrc9Q8CDN9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lrrc9Q8CDN9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lrrc9Q8CDN9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lrrc9Q8CDN9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lrrc9Q8CDN9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lrrc9Q8CDN9 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lrrc9Q8CDN9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Lrrc9Q8CDN9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lrrc9Q8CDN9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Lrrc9Q8CDN9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Lrrc9Q8CDN9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Lrrc9Q8CDN9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lrrc9Q8CDN9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Lrrc9Q8CDN9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lrrc9Q8CDN9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lrrc9Q8CDN9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lrrc9Q8CDN9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lrrc9Q8CDN9 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lrrc9Q8CDN9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lrrc9Q8CDN9 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lrrc9Q8CDN9 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Lrrc9Q8CDN9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lrrc9Q8CDN9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Lrrc9Q8CDN9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Lrrc9Q8CDN9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Lrrc9Q8CDN9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Lrrc9Q8CDN9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lrrc9Q8CDN9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lrrc9Q8CDN9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lrrc9Q8CDN9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lrrc9Q8CDN9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lrrc9Q8CDN9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lrrc9Q8CDN9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Lrrc9Q8CDN9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lrrc9Q8CDN9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lrrc9Q8CDN9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lrrc9Q8CDN9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lrrc9Q8CDN9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lrrc9Q8CDN9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Lrrc9Q8CDN9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms