Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAE9

Podxl2, Podocalyxin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podxl2Q8CAE9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Podxl2Q8CAE9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Podxl2Q8CAE9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Podxl2Q8CAE9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Podxl2Q8CAE9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Podxl2Q8CAE9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Podxl2Q8CAE9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Podxl2Q8CAE9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Podxl2Q8CAE9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Podxl2Q8CAE9 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Podxl2Q8CAE9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Podxl2Q8CAE9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Podxl2Q8CAE9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Podxl2Q8CAE9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Podxl2Q8CAE9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Podxl2Q8CAE9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Podxl2Q8CAE9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Podxl2Q8CAE9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Podxl2Q8CAE9 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Podxl2Q8CAE9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Podxl2Q8CAE9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Podxl2Q8CAE9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Podxl2Q8CAE9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Podxl2Q8CAE9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Podxl2Q8CAE9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Podxl2Q8CAE9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Podxl2Q8CAE9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Podxl2Q8CAE9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Podxl2Q8CAE9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Podxl2Q8CAE9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Podxl2Q8CAE9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Podxl2Q8CAE9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Podxl2Q8CAE9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Podxl2Q8CAE9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Podxl2Q8CAE9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Podxl2Q8CAE9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Podxl2Q8CAE9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Podxl2Q8CAE9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Podxl2Q8CAE9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Podxl2Q8CAE9 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Podxl2Q8CAE9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Podxl2Q8CAE9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Podxl2Q8CAE9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Podxl2Q8CAE9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Podxl2Q8CAE9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Podxl2Q8CAE9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Podxl2Q8CAE9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Podxl2Q8CAE9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Podxl2Q8CAE9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Podxl2Q8CAE9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Podxl2Q8CAE9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Podxl2Q8CAE9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Podxl2Q8CAE9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Podxl2Q8CAE9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Podxl2Q8CAE9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Podxl2Q8CAE9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Podxl2Q8CAE9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Podxl2Q8CAE9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Podxl2Q8CAE9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Podxl2Q8CAE9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Podxl2Q8CAE9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Podxl2Q8CAE9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Podxl2Q8CAE9 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Podxl2Q8CAE9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Podxl2Q8CAE9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Podxl2Q8CAE9 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Podxl2Q8CAE9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Podxl2Q8CAE9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Podxl2Q8CAE9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Podxl2Q8CAE9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Podxl2Q8CAE9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Podxl2Q8CAE9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Podxl2Q8CAE9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Podxl2Q8CAE9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Podxl2Q8CAE9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Podxl2Q8CAE9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Podxl2Q8CAE9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Podxl2Q8CAE9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Podxl2Q8CAE9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Podxl2Q8CAE9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Podxl2Q8CAE9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Podxl2Q8CAE9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Podxl2Q8CAE9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Podxl2Q8CAE9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Podxl2Q8CAE9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Podxl2Q8CAE9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Podxl2Q8CAE9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Podxl2Q8CAE9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Podxl2Q8CAE9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Podxl2Q8CAE9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Podxl2Q8CAE9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Podxl2Q8CAE9 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Podxl2Q8CAE9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Podxl2Q8CAE9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Podxl2Q8CAE9 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Podxl2Q8CAE9 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Podxl2Q8CAE9 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Podxl2Q8CAE9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Podxl2Q8CAE9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Podxl2Q8CAE9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 195.1 ms