Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7G5

Apoa5, Apolipoprotein A-V, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa5Q8C7G5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apoa5Q8C7G5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apoa5Q8C7G5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apoa5Q8C7G5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apoa5Q8C7G5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apoa5Q8C7G5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apoa5Q8C7G5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apoa5Q8C7G5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apoa5Q8C7G5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apoa5Q8C7G5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apoa5Q8C7G5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apoa5Q8C7G5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apoa5Q8C7G5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apoa5Q8C7G5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apoa5Q8C7G5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apoa5Q8C7G5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apoa5Q8C7G5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apoa5Q8C7G5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apoa5Q8C7G5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Apoa5Q8C7G5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apoa5Q8C7G5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apoa5Q8C7G5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apoa5Q8C7G5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apoa5Q8C7G5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apoa5Q8C7G5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apoa5Q8C7G5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apoa5Q8C7G5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apoa5Q8C7G5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apoa5Q8C7G5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Apoa5Q8C7G5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apoa5Q8C7G5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apoa5Q8C7G5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apoa5Q8C7G5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apoa5Q8C7G5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apoa5Q8C7G5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apoa5Q8C7G5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apoa5Q8C7G5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apoa5Q8C7G5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apoa5Q8C7G5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Apoa5Q8C7G5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apoa5Q8C7G5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apoa5Q8C7G5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apoa5Q8C7G5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apoa5Q8C7G5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apoa5Q8C7G5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apoa5Q8C7G5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Apoa5Q8C7G5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apoa5Q8C7G5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Apoa5Q8C7G5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Apoa5Q8C7G5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Apoa5Q8C7G5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apoa5Q8C7G5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Apoa5Q8C7G5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apoa5Q8C7G5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apoa5Q8C7G5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apoa5Q8C7G5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apoa5Q8C7G5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apoa5Q8C7G5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apoa5Q8C7G5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Apoa5Q8C7G5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apoa5Q8C7G5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apoa5Q8C7G5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apoa5Q8C7G5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apoa5Q8C7G5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apoa5Q8C7G5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Apoa5Q8C7G5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apoa5Q8C7G5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apoa5Q8C7G5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apoa5Q8C7G5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apoa5Q8C7G5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apoa5Q8C7G5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apoa5Q8C7G5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apoa5Q8C7G5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apoa5Q8C7G5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Apoa5Q8C7G5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apoa5Q8C7G5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apoa5Q8C7G5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apoa5Q8C7G5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apoa5Q8C7G5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apoa5Q8C7G5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Apoa5Q8C7G5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apoa5Q8C7G5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apoa5Q8C7G5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apoa5Q8C7G5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apoa5Q8C7G5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apoa5Q8C7G5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apoa5Q8C7G5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apoa5Q8C7G5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apoa5Q8C7G5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Apoa5Q8C7G5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apoa5Q8C7G5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apoa5Q8C7G5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apoa5Q8C7G5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apoa5Q8C7G5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apoa5Q8C7G5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apoa5Q8C7G5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apoa5Q8C7G5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apoa5Q8C7G5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apoa5Q8C7G5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apoa5Q8C7G5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms