Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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Ccdc113Q8C5T8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc113Q8C5T8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc113Q8C5T8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc113Q8C5T8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc113Q8C5T8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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Ccdc113Q8C5T8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc113Q8C5T8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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Ccdc113Q8C5T8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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Ccdc113Q8C5T8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc113Q8C5T8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc113Q8C5T8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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Ccdc113Q8C5T8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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Ccdc113Q8C5T8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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Ccdc113Q8C5T8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc113Q8C5T8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc113Q8C5T8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc113Q8C5T8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
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Ccdc113Q8C5T8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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Ccdc113Q8C5T8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc113Q8C5T8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc113Q8C5T8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc113Q8C5T8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc113Q8C5T8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc113Q8C5T8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc113Q8C5T8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc113Q8C5T8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc113Q8C5T8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc113Q8C5T8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc113Q8C5T8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc113Q8C5T8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc113Q8C5T8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc113Q8C5T8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc113Q8C5T8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc113Q8C5T8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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Ccdc113Q8C5T8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc113Q8C5T8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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Ccdc113Q8C5T8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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Ccdc113Q8C5T8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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Ccdc113Q8C5T8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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