Protein–RNA interactions for Protein: Q8C561

Lmbrd2, LMBR1 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd2Q8C561 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lmbrd2Q8C561 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmbrd2Q8C561 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmbrd2Q8C561 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmbrd2Q8C561 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmbrd2Q8C561 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmbrd2Q8C561 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmbrd2Q8C561 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmbrd2Q8C561 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmbrd2Q8C561 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmbrd2Q8C561 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmbrd2Q8C561 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmbrd2Q8C561 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmbrd2Q8C561 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmbrd2Q8C561 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmbrd2Q8C561 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmbrd2Q8C561 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmbrd2Q8C561 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmbrd2Q8C561 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmbrd2Q8C561 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmbrd2Q8C561 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmbrd2Q8C561 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmbrd2Q8C561 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmbrd2Q8C561 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmbrd2Q8C561 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmbrd2Q8C561 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmbrd2Q8C561 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmbrd2Q8C561 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmbrd2Q8C561 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmbrd2Q8C561 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmbrd2Q8C561 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmbrd2Q8C561 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmbrd2Q8C561 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmbrd2Q8C561 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmbrd2Q8C561 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmbrd2Q8C561 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmbrd2Q8C561 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmbrd2Q8C561 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmbrd2Q8C561 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmbrd2Q8C561 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmbrd2Q8C561 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmbrd2Q8C561 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmbrd2Q8C561 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmbrd2Q8C561 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmbrd2Q8C561 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmbrd2Q8C561 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmbrd2Q8C561 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmbrd2Q8C561 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmbrd2Q8C561 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmbrd2Q8C561 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmbrd2Q8C561 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmbrd2Q8C561 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmbrd2Q8C561 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmbrd2Q8C561 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmbrd2Q8C561 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmbrd2Q8C561 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmbrd2Q8C561 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmbrd2Q8C561 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmbrd2Q8C561 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmbrd2Q8C561 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmbrd2Q8C561 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmbrd2Q8C561 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmbrd2Q8C561 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmbrd2Q8C561 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmbrd2Q8C561 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmbrd2Q8C561 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmbrd2Q8C561 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmbrd2Q8C561 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmbrd2Q8C561 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmbrd2Q8C561 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmbrd2Q8C561 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmbrd2Q8C561 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmbrd2Q8C561 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmbrd2Q8C561 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lmbrd2Q8C561 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lmbrd2Q8C561 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmbrd2Q8C561 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmbrd2Q8C561 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmbrd2Q8C561 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmbrd2Q8C561 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmbrd2Q8C561 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmbrd2Q8C561 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmbrd2Q8C561 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmbrd2Q8C561 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmbrd2Q8C561 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmbrd2Q8C561 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmbrd2Q8C561 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmbrd2Q8C561 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmbrd2Q8C561 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmbrd2Q8C561 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmbrd2Q8C561 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmbrd2Q8C561 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmbrd2Q8C561 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmbrd2Q8C561 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmbrd2Q8C561 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmbrd2Q8C561 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmbrd2Q8C561 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmbrd2Q8C561 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmbrd2Q8C561 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmbrd2Q8C561 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms