Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S0

Usp44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, mousemouse

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Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp44Q8C2S0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp44Q8C2S0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp44Q8C2S0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp44Q8C2S0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp44Q8C2S0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp44Q8C2S0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp44Q8C2S0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp44Q8C2S0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp44Q8C2S0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp44Q8C2S0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp44Q8C2S0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp44Q8C2S0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp44Q8C2S0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp44Q8C2S0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp44Q8C2S0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp44Q8C2S0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp44Q8C2S0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp44Q8C2S0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp44Q8C2S0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp44Q8C2S0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp44Q8C2S0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp44Q8C2S0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp44Q8C2S0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp44Q8C2S0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp44Q8C2S0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp44Q8C2S0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp44Q8C2S0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp44Q8C2S0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp44Q8C2S0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp44Q8C2S0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp44Q8C2S0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp44Q8C2S0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp44Q8C2S0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp44Q8C2S0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp44Q8C2S0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp44Q8C2S0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp44Q8C2S0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp44Q8C2S0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp44Q8C2S0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp44Q8C2S0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp44Q8C2S0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp44Q8C2S0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp44Q8C2S0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp44Q8C2S0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp44Q8C2S0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp44Q8C2S0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp44Q8C2S0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp44Q8C2S0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp44Q8C2S0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp44Q8C2S0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp44Q8C2S0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp44Q8C2S0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp44Q8C2S0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp44Q8C2S0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp44Q8C2S0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp44Q8C2S0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp44Q8C2S0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp44Q8C2S0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp44Q8C2S0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp44Q8C2S0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp44Q8C2S0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp44Q8C2S0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp44Q8C2S0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp44Q8C2S0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp44Q8C2S0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp44Q8C2S0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp44Q8C2S0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp44Q8C2S0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp44Q8C2S0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp44Q8C2S0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp44Q8C2S0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp44Q8C2S0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp44Q8C2S0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp44Q8C2S0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp44Q8C2S0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp44Q8C2S0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp44Q8C2S0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp44Q8C2S0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp44Q8C2S0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp44Q8C2S0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp44Q8C2S0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp44Q8C2S0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp44Q8C2S0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp44Q8C2S0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp44Q8C2S0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp44Q8C2S0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp44Q8C2S0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp44Q8C2S0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp44Q8C2S0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp44Q8C2S0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp44Q8C2S0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp44Q8C2S0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp44Q8C2S0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp44Q8C2S0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp44Q8C2S0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp44Q8C2S0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp44Q8C2S0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp44Q8C2S0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp44Q8C2S0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp44Q8C2S0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
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