Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYK4

Rdh12, Retinol dehydrogenase 12, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh12Q8BYK4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rdh12Q8BYK4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rdh12Q8BYK4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rdh12Q8BYK4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rdh12Q8BYK4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rdh12Q8BYK4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rdh12Q8BYK4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rdh12Q8BYK4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rdh12Q8BYK4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rdh12Q8BYK4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rdh12Q8BYK4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rdh12Q8BYK4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rdh12Q8BYK4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rdh12Q8BYK4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rdh12Q8BYK4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rdh12Q8BYK4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rdh12Q8BYK4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rdh12Q8BYK4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdh12Q8BYK4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdh12Q8BYK4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdh12Q8BYK4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdh12Q8BYK4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdh12Q8BYK4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdh12Q8BYK4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdh12Q8BYK4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdh12Q8BYK4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdh12Q8BYK4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdh12Q8BYK4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdh12Q8BYK4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rdh12Q8BYK4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rdh12Q8BYK4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rdh12Q8BYK4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rdh12Q8BYK4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rdh12Q8BYK4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rdh12Q8BYK4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rdh12Q8BYK4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rdh12Q8BYK4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rdh12Q8BYK4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rdh12Q8BYK4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rdh12Q8BYK4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rdh12Q8BYK4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rdh12Q8BYK4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rdh12Q8BYK4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rdh12Q8BYK4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rdh12Q8BYK4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rdh12Q8BYK4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rdh12Q8BYK4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rdh12Q8BYK4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rdh12Q8BYK4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rdh12Q8BYK4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rdh12Q8BYK4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rdh12Q8BYK4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rdh12Q8BYK4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rdh12Q8BYK4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rdh12Q8BYK4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rdh12Q8BYK4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rdh12Q8BYK4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rdh12Q8BYK4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rdh12Q8BYK4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rdh12Q8BYK4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rdh12Q8BYK4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rdh12Q8BYK4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rdh12Q8BYK4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rdh12Q8BYK4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rdh12Q8BYK4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rdh12Q8BYK4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rdh12Q8BYK4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rdh12Q8BYK4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rdh12Q8BYK4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rdh12Q8BYK4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rdh12Q8BYK4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rdh12Q8BYK4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rdh12Q8BYK4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rdh12Q8BYK4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rdh12Q8BYK4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rdh12Q8BYK4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rdh12Q8BYK4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rdh12Q8BYK4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rdh12Q8BYK4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rdh12Q8BYK4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rdh12Q8BYK4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rdh12Q8BYK4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rdh12Q8BYK4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rdh12Q8BYK4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rdh12Q8BYK4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rdh12Q8BYK4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rdh12Q8BYK4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rdh12Q8BYK4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rdh12Q8BYK4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rdh12Q8BYK4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rdh12Q8BYK4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rdh12Q8BYK4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rdh12Q8BYK4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rdh12Q8BYK4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rdh12Q8BYK4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rdh12Q8BYK4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rdh12Q8BYK4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rdh12Q8BYK4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rdh12Q8BYK4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rdh12Q8BYK4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms