Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYH8

Chd9, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 2,885 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd9Q8BYH8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Chd9Q8BYH8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Chd9Q8BYH8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Chd9Q8BYH8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Chd9Q8BYH8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Chd9Q8BYH8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Chd9Q8BYH8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Chd9Q8BYH8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Chd9Q8BYH8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chd9Q8BYH8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Chd9Q8BYH8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Chd9Q8BYH8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chd9Q8BYH8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chd9Q8BYH8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chd9Q8BYH8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chd9Q8BYH8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chd9Q8BYH8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chd9Q8BYH8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chd9Q8BYH8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chd9Q8BYH8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Chd9Q8BYH8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chd9Q8BYH8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chd9Q8BYH8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chd9Q8BYH8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Chd9Q8BYH8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chd9Q8BYH8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Chd9Q8BYH8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chd9Q8BYH8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chd9Q8BYH8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chd9Q8BYH8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chd9Q8BYH8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chd9Q8BYH8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chd9Q8BYH8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chd9Q8BYH8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chd9Q8BYH8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chd9Q8BYH8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chd9Q8BYH8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chd9Q8BYH8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chd9Q8BYH8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chd9Q8BYH8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chd9Q8BYH8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chd9Q8BYH8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chd9Q8BYH8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Chd9Q8BYH8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chd9Q8BYH8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chd9Q8BYH8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chd9Q8BYH8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chd9Q8BYH8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chd9Q8BYH8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Chd9Q8BYH8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chd9Q8BYH8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chd9Q8BYH8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chd9Q8BYH8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chd9Q8BYH8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chd9Q8BYH8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chd9Q8BYH8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chd9Q8BYH8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chd9Q8BYH8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chd9Q8BYH8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chd9Q8BYH8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chd9Q8BYH8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Chd9Q8BYH8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chd9Q8BYH8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chd9Q8BYH8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chd9Q8BYH8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chd9Q8BYH8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chd9Q8BYH8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Chd9Q8BYH8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chd9Q8BYH8 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chd9Q8BYH8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chd9Q8BYH8 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chd9Q8BYH8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chd9Q8BYH8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chd9Q8BYH8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chd9Q8BYH8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chd9Q8BYH8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chd9Q8BYH8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chd9Q8BYH8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chd9Q8BYH8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chd9Q8BYH8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chd9Q8BYH8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chd9Q8BYH8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chd9Q8BYH8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Chd9Q8BYH8 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chd9Q8BYH8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chd9Q8BYH8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chd9Q8BYH8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chd9Q8BYH8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Chd9Q8BYH8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Chd9Q8BYH8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chd9Q8BYH8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chd9Q8BYH8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chd9Q8BYH8 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chd9Q8BYH8 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Chd9Q8BYH8 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chd9Q8BYH8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chd9Q8BYH8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chd9Q8BYH8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chd9Q8BYH8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chd9Q8BYH8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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