Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXF8

Actrt3, Actin-related protein T3, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt3Q8BXF8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Actrt3Q8BXF8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Actrt3Q8BXF8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Actrt3Q8BXF8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Actrt3Q8BXF8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Actrt3Q8BXF8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Actrt3Q8BXF8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Actrt3Q8BXF8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Actrt3Q8BXF8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Actrt3Q8BXF8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Actrt3Q8BXF8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Actrt3Q8BXF8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Actrt3Q8BXF8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Actrt3Q8BXF8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Actrt3Q8BXF8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Actrt3Q8BXF8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Actrt3Q8BXF8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actrt3Q8BXF8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actrt3Q8BXF8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actrt3Q8BXF8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actrt3Q8BXF8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actrt3Q8BXF8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actrt3Q8BXF8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actrt3Q8BXF8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actrt3Q8BXF8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actrt3Q8BXF8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actrt3Q8BXF8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actrt3Q8BXF8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actrt3Q8BXF8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Actrt3Q8BXF8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actrt3Q8BXF8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actrt3Q8BXF8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actrt3Q8BXF8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actrt3Q8BXF8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Actrt3Q8BXF8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actrt3Q8BXF8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actrt3Q8BXF8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actrt3Q8BXF8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Actrt3Q8BXF8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Actrt3Q8BXF8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Actrt3Q8BXF8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Actrt3Q8BXF8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms