Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rbbp5Q8BX09 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rbbp5Q8BX09 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rbbp5Q8BX09 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rbbp5Q8BX09 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rbbp5Q8BX09 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbbp5Q8BX09 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbbp5Q8BX09 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbbp5Q8BX09 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbbp5Q8BX09 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbbp5Q8BX09 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbbp5Q8BX09 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbbp5Q8BX09 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbbp5Q8BX09 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbbp5Q8BX09 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbbp5Q8BX09 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbbp5Q8BX09 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbbp5Q8BX09 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbbp5Q8BX09 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbbp5Q8BX09 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbbp5Q8BX09 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbbp5Q8BX09 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbbp5Q8BX09 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbbp5Q8BX09 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbbp5Q8BX09 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbbp5Q8BX09 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbbp5Q8BX09 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rbbp5Q8BX09 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rbbp5Q8BX09 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rbbp5Q8BX09 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rbbp5Q8BX09 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rbbp5Q8BX09 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rbbp5Q8BX09 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rbbp5Q8BX09 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rbbp5Q8BX09 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rbbp5Q8BX09 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rbbp5Q8BX09 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rbbp5Q8BX09 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbbp5Q8BX09 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbbp5Q8BX09 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms