Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ctdsp2Q8BX07 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ctdsp2Q8BX07 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ctdsp2Q8BX07 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ctdsp2Q8BX07 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ctdsp2Q8BX07 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ctdsp2Q8BX07 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ctdsp2Q8BX07 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctdsp2Q8BX07 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctdsp2Q8BX07 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctdsp2Q8BX07 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctdsp2Q8BX07 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctdsp2Q8BX07 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctdsp2Q8BX07 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctdsp2Q8BX07 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctdsp2Q8BX07 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctdsp2Q8BX07 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctdsp2Q8BX07 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms