Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVP1

Triml1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML1, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Triml1Q8BVP1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Triml1Q8BVP1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Triml1Q8BVP1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Triml1Q8BVP1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Triml1Q8BVP1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Triml1Q8BVP1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Triml1Q8BVP1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Triml1Q8BVP1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Triml1Q8BVP1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Triml1Q8BVP1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Triml1Q8BVP1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Triml1Q8BVP1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Triml1Q8BVP1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Triml1Q8BVP1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Triml1Q8BVP1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Triml1Q8BVP1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Triml1Q8BVP1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Triml1Q8BVP1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Triml1Q8BVP1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Triml1Q8BVP1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Triml1Q8BVP1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Triml1Q8BVP1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Triml1Q8BVP1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Triml1Q8BVP1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Triml1Q8BVP1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Triml1Q8BVP1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Triml1Q8BVP1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Triml1Q8BVP1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Triml1Q8BVP1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Triml1Q8BVP1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Triml1Q8BVP1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Triml1Q8BVP1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Triml1Q8BVP1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Triml1Q8BVP1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Triml1Q8BVP1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Triml1Q8BVP1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Triml1Q8BVP1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Triml1Q8BVP1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Triml1Q8BVP1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Triml1Q8BVP1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Triml1Q8BVP1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Triml1Q8BVP1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Triml1Q8BVP1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Triml1Q8BVP1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Triml1Q8BVP1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Triml1Q8BVP1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Triml1Q8BVP1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Triml1Q8BVP1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Triml1Q8BVP1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Triml1Q8BVP1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Triml1Q8BVP1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Triml1Q8BVP1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Triml1Q8BVP1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Triml1Q8BVP1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Triml1Q8BVP1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Triml1Q8BVP1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Triml1Q8BVP1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Triml1Q8BVP1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Triml1Q8BVP1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Triml1Q8BVP1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Triml1Q8BVP1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Triml1Q8BVP1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Triml1Q8BVP1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Triml1Q8BVP1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Triml1Q8BVP1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Triml1Q8BVP1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Triml1Q8BVP1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Triml1Q8BVP1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Triml1Q8BVP1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Triml1Q8BVP1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Triml1Q8BVP1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Triml1Q8BVP1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Triml1Q8BVP1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Triml1Q8BVP1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Triml1Q8BVP1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Triml1Q8BVP1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Triml1Q8BVP1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Triml1Q8BVP1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Triml1Q8BVP1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Triml1Q8BVP1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Triml1Q8BVP1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Triml1Q8BVP1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Triml1Q8BVP1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Triml1Q8BVP1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Triml1Q8BVP1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Triml1Q8BVP1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Triml1Q8BVP1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Triml1Q8BVP1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Triml1Q8BVP1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Triml1Q8BVP1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Triml1Q8BVP1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Triml1Q8BVP1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Triml1Q8BVP1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Triml1Q8BVP1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Triml1Q8BVP1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Triml1Q8BVP1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Triml1Q8BVP1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Triml1Q8BVP1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Triml1Q8BVP1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Triml1Q8BVP1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms