Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVN3

Catsper4, Cation channel sperm-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsper4Q8BVN3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Catsper4Q8BVN3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Catsper4Q8BVN3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Catsper4Q8BVN3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Catsper4Q8BVN3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Catsper4Q8BVN3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Catsper4Q8BVN3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Catsper4Q8BVN3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Catsper4Q8BVN3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Catsper4Q8BVN3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Catsper4Q8BVN3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Catsper4Q8BVN3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Catsper4Q8BVN3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Catsper4Q8BVN3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Catsper4Q8BVN3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Catsper4Q8BVN3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Catsper4Q8BVN3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Catsper4Q8BVN3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Catsper4Q8BVN3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Catsper4Q8BVN3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Catsper4Q8BVN3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Catsper4Q8BVN3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Catsper4Q8BVN3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Catsper4Q8BVN3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Catsper4Q8BVN3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Catsper4Q8BVN3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Catsper4Q8BVN3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Catsper4Q8BVN3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Catsper4Q8BVN3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Catsper4Q8BVN3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Catsper4Q8BVN3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Catsper4Q8BVN3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Catsper4Q8BVN3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Catsper4Q8BVN3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Catsper4Q8BVN3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Catsper4Q8BVN3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Catsper4Q8BVN3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Catsper4Q8BVN3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Catsper4Q8BVN3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Catsper4Q8BVN3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Catsper4Q8BVN3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Catsper4Q8BVN3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Catsper4Q8BVN3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Catsper4Q8BVN3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Catsper4Q8BVN3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Catsper4Q8BVN3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Catsper4Q8BVN3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Catsper4Q8BVN3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Catsper4Q8BVN3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Catsper4Q8BVN3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Catsper4Q8BVN3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Catsper4Q8BVN3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Catsper4Q8BVN3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Catsper4Q8BVN3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Catsper4Q8BVN3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Catsper4Q8BVN3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Catsper4Q8BVN3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Catsper4Q8BVN3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Catsper4Q8BVN3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Catsper4Q8BVN3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Catsper4Q8BVN3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Catsper4Q8BVN3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Catsper4Q8BVN3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Catsper4Q8BVN3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Catsper4Q8BVN3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Catsper4Q8BVN3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Catsper4Q8BVN3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Catsper4Q8BVN3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Catsper4Q8BVN3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Catsper4Q8BVN3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Catsper4Q8BVN3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Catsper4Q8BVN3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Catsper4Q8BVN3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Catsper4Q8BVN3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Catsper4Q8BVN3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Catsper4Q8BVN3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Catsper4Q8BVN3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Catsper4Q8BVN3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Catsper4Q8BVN3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Catsper4Q8BVN3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Catsper4Q8BVN3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Catsper4Q8BVN3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Catsper4Q8BVN3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Catsper4Q8BVN3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Catsper4Q8BVN3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Catsper4Q8BVN3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Catsper4Q8BVN3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Catsper4Q8BVN3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Catsper4Q8BVN3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Catsper4Q8BVN3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Catsper4Q8BVN3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Catsper4Q8BVN3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Catsper4Q8BVN3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Catsper4Q8BVN3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Catsper4Q8BVN3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Catsper4Q8BVN3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Catsper4Q8BVN3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Catsper4Q8BVN3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Catsper4Q8BVN3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Catsper4Q8BVN3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms