Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmod1Q8BVA4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmod1Q8BVA4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmod1Q8BVA4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmod1Q8BVA4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmod1Q8BVA4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmod1Q8BVA4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmod1Q8BVA4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmod1Q8BVA4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmod1Q8BVA4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmod1Q8BVA4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmod1Q8BVA4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmod1Q8BVA4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmod1Q8BVA4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmod1Q8BVA4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmod1Q8BVA4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmod1Q8BVA4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmod1Q8BVA4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmod1Q8BVA4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmod1Q8BVA4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmod1Q8BVA4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmod1Q8BVA4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmod1Q8BVA4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmod1Q8BVA4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmod1Q8BVA4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmod1Q8BVA4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmod1Q8BVA4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmod1Q8BVA4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmod1Q8BVA4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmod1Q8BVA4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmod1Q8BVA4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmod1Q8BVA4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmod1Q8BVA4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmod1Q8BVA4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmod1Q8BVA4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmod1Q8BVA4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmod1Q8BVA4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmod1Q8BVA4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmod1Q8BVA4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmod1Q8BVA4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmod1Q8BVA4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmod1Q8BVA4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmod1Q8BVA4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmod1Q8BVA4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmod1Q8BVA4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmod1Q8BVA4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmod1Q8BVA4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmod1Q8BVA4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmod1Q8BVA4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmod1Q8BVA4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmod1Q8BVA4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmod1Q8BVA4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmod1Q8BVA4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmod1Q8BVA4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmod1Q8BVA4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmod1Q8BVA4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmod1Q8BVA4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmod1Q8BVA4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmod1Q8BVA4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmod1Q8BVA4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmod1Q8BVA4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmod1Q8BVA4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmod1Q8BVA4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmod1Q8BVA4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmod1Q8BVA4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmod1Q8BVA4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmod1Q8BVA4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmod1Q8BVA4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmod1Q8BVA4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmod1Q8BVA4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmod1Q8BVA4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmod1Q8BVA4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmod1Q8BVA4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmod1Q8BVA4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmod1Q8BVA4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmod1Q8BVA4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmod1Q8BVA4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmod1Q8BVA4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmod1Q8BVA4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmod1Q8BVA4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmod1Q8BVA4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmod1Q8BVA4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmod1Q8BVA4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmod1Q8BVA4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmod1Q8BVA4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmod1Q8BVA4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmod1Q8BVA4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmod1Q8BVA4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmod1Q8BVA4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmod1Q8BVA4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmod1Q8BVA4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmod1Q8BVA4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmod1Q8BVA4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmod1Q8BVA4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmod1Q8BVA4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmod1Q8BVA4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmod1Q8BVA4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmod1Q8BVA4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmod1Q8BVA4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmod1Q8BVA4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms