Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Pggt1bQ8BUY9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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Pggt1bQ8BUY9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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Pggt1bQ8BUY9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pggt1bQ8BUY9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms