Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ57

Gm10600, Predicted gene 10600, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10600Q8BQ57 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm10600Q8BQ57 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm10600Q8BQ57 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm10600Q8BQ57 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm10600Q8BQ57 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm10600Q8BQ57 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm10600Q8BQ57 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm10600Q8BQ57 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm10600Q8BQ57 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm10600Q8BQ57 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm10600Q8BQ57 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm10600Q8BQ57 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm10600Q8BQ57 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm10600Q8BQ57 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm10600Q8BQ57 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm10600Q8BQ57 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm10600Q8BQ57 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm10600Q8BQ57 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm10600Q8BQ57 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm10600Q8BQ57 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm10600Q8BQ57 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm10600Q8BQ57 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm10600Q8BQ57 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm10600Q8BQ57 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm10600Q8BQ57 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm10600Q8BQ57 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm10600Q8BQ57 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm10600Q8BQ57 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm10600Q8BQ57 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm10600Q8BQ57 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm10600Q8BQ57 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm10600Q8BQ57 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm10600Q8BQ57 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm10600Q8BQ57 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm10600Q8BQ57 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm10600Q8BQ57 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm10600Q8BQ57 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm10600Q8BQ57 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm10600Q8BQ57 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm10600Q8BQ57 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm10600Q8BQ57 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm10600Q8BQ57 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm10600Q8BQ57 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm10600Q8BQ57 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm10600Q8BQ57 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm10600Q8BQ57 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm10600Q8BQ57 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm10600Q8BQ57 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm10600Q8BQ57 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm10600Q8BQ57 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm10600Q8BQ57 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm10600Q8BQ57 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm10600Q8BQ57 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm10600Q8BQ57 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm10600Q8BQ57 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm10600Q8BQ57 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm10600Q8BQ57 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm10600Q8BQ57 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm10600Q8BQ57 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm10600Q8BQ57 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm10600Q8BQ57 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm10600Q8BQ57 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm10600Q8BQ57 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm10600Q8BQ57 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm10600Q8BQ57 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm10600Q8BQ57 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm10600Q8BQ57 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm10600Q8BQ57 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm10600Q8BQ57 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm10600Q8BQ57 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm10600Q8BQ57 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm10600Q8BQ57 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm10600Q8BQ57 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm10600Q8BQ57 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm10600Q8BQ57 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm10600Q8BQ57 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm10600Q8BQ57 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm10600Q8BQ57 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm10600Q8BQ57 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm10600Q8BQ57 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm10600Q8BQ57 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm10600Q8BQ57 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm10600Q8BQ57 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm10600Q8BQ57 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm10600Q8BQ57 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm10600Q8BQ57 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm10600Q8BQ57 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm10600Q8BQ57 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm10600Q8BQ57 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm10600Q8BQ57 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm10600Q8BQ57 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm10600Q8BQ57 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm10600Q8BQ57 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm10600Q8BQ57 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm10600Q8BQ57 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm10600Q8BQ57 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm10600Q8BQ57 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm10600Q8BQ57 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm10600Q8BQ57 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm10600Q8BQ57 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms