Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMV6

E130116L18Rik, RIKEN cDNA E130116L18 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130116L18RikQ8BMV6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E130116L18RikQ8BMV6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E130116L18RikQ8BMV6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms