Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zcchc4Q8BKW4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zcchc4Q8BKW4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zcchc4Q8BKW4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zcchc4Q8BKW4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zcchc4Q8BKW4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zcchc4Q8BKW4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zcchc4Q8BKW4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Zcchc4Q8BKW4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zcchc4Q8BKW4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zcchc4Q8BKW4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zcchc4Q8BKW4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zcchc4Q8BKW4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zcchc4Q8BKW4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zcchc4Q8BKW4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zcchc4Q8BKW4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zcchc4Q8BKW4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zcchc4Q8BKW4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zcchc4Q8BKW4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Zcchc4Q8BKW4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Zcchc4Q8BKW4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zcchc4Q8BKW4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zcchc4Q8BKW4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zcchc4Q8BKW4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zcchc4Q8BKW4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zcchc4Q8BKW4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zcchc4Q8BKW4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms