Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nop53Q8BK35 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nop53Q8BK35 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nop53Q8BK35 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nop53Q8BK35 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nop53Q8BK35 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nop53Q8BK35 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nop53Q8BK35 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nop53Q8BK35 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nop53Q8BK35 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nop53Q8BK35 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nop53Q8BK35 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nop53Q8BK35 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nop53Q8BK35 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nop53Q8BK35 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nop53Q8BK35 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nop53Q8BK35 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nop53Q8BK35 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nop53Q8BK35 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nop53Q8BK35 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nop53Q8BK35 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nop53Q8BK35 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nop53Q8BK35 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nop53Q8BK35 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nop53Q8BK35 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nop53Q8BK35 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nop53Q8BK35 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nop53Q8BK35 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nop53Q8BK35 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nop53Q8BK35 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nop53Q8BK35 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nop53Q8BK35 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nop53Q8BK35 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nop53Q8BK35 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nop53Q8BK35 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nop53Q8BK35 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nop53Q8BK35 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Nop53Q8BK35 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nop53Q8BK35 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nop53Q8BK35 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nop53Q8BK35 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nop53Q8BK35 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nop53Q8BK35 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nop53Q8BK35 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nop53Q8BK35 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Nop53Q8BK35 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nop53Q8BK35 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nop53Q8BK35 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nop53Q8BK35 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nop53Q8BK35 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nop53Q8BK35 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nop53Q8BK35 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nop53Q8BK35 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nop53Q8BK35 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nop53Q8BK35 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nop53Q8BK35 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nop53Q8BK35 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nop53Q8BK35 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nop53Q8BK35 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nop53Q8BK35 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nop53Q8BK35 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nop53Q8BK35 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Nop53Q8BK35 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nop53Q8BK35 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nop53Q8BK35 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nop53Q8BK35 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nop53Q8BK35 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nop53Q8BK35 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nop53Q8BK35 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nop53Q8BK35 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nop53Q8BK35 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nop53Q8BK35 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nop53Q8BK35 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nop53Q8BK35 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nop53Q8BK35 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nop53Q8BK35 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nop53Q8BK35 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nop53Q8BK35 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nop53Q8BK35 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nop53Q8BK35 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nop53Q8BK35 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nop53Q8BK35 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nop53Q8BK35 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nop53Q8BK35 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nop53Q8BK35 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nop53Q8BK35 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nop53Q8BK35 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nop53Q8BK35 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nop53Q8BK35 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nop53Q8BK35 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nop53Q8BK35 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nop53Q8BK35 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nop53Q8BK35 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nop53Q8BK35 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Nop53Q8BK35 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nop53Q8BK35 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nop53Q8BK35 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nop53Q8BK35 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nop53Q8BK35 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nop53Q8BK35 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms