Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rufy1Q8BIJ7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms