Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms