Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG71

Trmt12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt12Q8BG71 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trmt12Q8BG71 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Trmt12Q8BG71 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trmt12Q8BG71 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trmt12Q8BG71 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trmt12Q8BG71 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trmt12Q8BG71 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trmt12Q8BG71 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trmt12Q8BG71 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trmt12Q8BG71 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms