Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG39

Sv2b, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2bQ8BG39 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sv2bQ8BG39 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sv2bQ8BG39 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Sv2bQ8BG39 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sv2bQ8BG39 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sv2bQ8BG39 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sv2bQ8BG39 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sv2bQ8BG39 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Sv2bQ8BG39 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sv2bQ8BG39 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sv2bQ8BG39 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sv2bQ8BG39 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sv2bQ8BG39 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sv2bQ8BG39 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sv2bQ8BG39 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sv2bQ8BG39 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Sv2bQ8BG39 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sv2bQ8BG39 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sv2bQ8BG39 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sv2bQ8BG39 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sv2bQ8BG39 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sv2bQ8BG39 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sv2bQ8BG39 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sv2bQ8BG39 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sv2bQ8BG39 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sv2bQ8BG39 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sv2bQ8BG39 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sv2bQ8BG39 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sv2bQ8BG39 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sv2bQ8BG39 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sv2bQ8BG39 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sv2bQ8BG39 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sv2bQ8BG39 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sv2bQ8BG39 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sv2bQ8BG39 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sv2bQ8BG39 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sv2bQ8BG39 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Sv2bQ8BG39 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sv2bQ8BG39 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Sv2bQ8BG39 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sv2bQ8BG39 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sv2bQ8BG39 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sv2bQ8BG39 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sv2bQ8BG39 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sv2bQ8BG39 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sv2bQ8BG39 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sv2bQ8BG39 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sv2bQ8BG39 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sv2bQ8BG39 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sv2bQ8BG39 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sv2bQ8BG39 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Sv2bQ8BG39 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sv2bQ8BG39 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sv2bQ8BG39 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sv2bQ8BG39 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sv2bQ8BG39 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sv2bQ8BG39 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sv2bQ8BG39 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sv2bQ8BG39 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sv2bQ8BG39 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sv2bQ8BG39 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sv2bQ8BG39 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sv2bQ8BG39 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sv2bQ8BG39 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sv2bQ8BG39 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sv2bQ8BG39 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sv2bQ8BG39 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Sv2bQ8BG39 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sv2bQ8BG39 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sv2bQ8BG39 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sv2bQ8BG39 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sv2bQ8BG39 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sv2bQ8BG39 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sv2bQ8BG39 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sv2bQ8BG39 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sv2bQ8BG39 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sv2bQ8BG39 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Sv2bQ8BG39 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sv2bQ8BG39 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sv2bQ8BG39 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sv2bQ8BG39 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sv2bQ8BG39 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Sv2bQ8BG39 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sv2bQ8BG39 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sv2bQ8BG39 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sv2bQ8BG39 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sv2bQ8BG39 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sv2bQ8BG39 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Sv2bQ8BG39 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sv2bQ8BG39 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sv2bQ8BG39 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sv2bQ8BG39 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sv2bQ8BG39 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sv2bQ8BG39 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sv2bQ8BG39 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sv2bQ8BG39 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sv2bQ8BG39 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sv2bQ8BG39 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sv2bQ8BG39 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sv2bQ8BG39 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms