Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG15

Ctdspl2, CTD small phosphatase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdspl2Q8BG15 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctdspl2Q8BG15 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctdspl2Q8BG15 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctdspl2Q8BG15 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctdspl2Q8BG15 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctdspl2Q8BG15 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctdspl2Q8BG15 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctdspl2Q8BG15 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctdspl2Q8BG15 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctdspl2Q8BG15 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctdspl2Q8BG15 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctdspl2Q8BG15 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctdspl2Q8BG15 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctdspl2Q8BG15 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctdspl2Q8BG15 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctdspl2Q8BG15 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctdspl2Q8BG15 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctdspl2Q8BG15 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctdspl2Q8BG15 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctdspl2Q8BG15 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctdspl2Q8BG15 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctdspl2Q8BG15 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctdspl2Q8BG15 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctdspl2Q8BG15 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctdspl2Q8BG15 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctdspl2Q8BG15 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctdspl2Q8BG15 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctdspl2Q8BG15 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctdspl2Q8BG15 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Ctdspl2Q8BG15 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ctdspl2Q8BG15 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ctdspl2Q8BG15 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ctdspl2Q8BG15 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ctdspl2Q8BG15 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ctdspl2Q8BG15 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ctdspl2Q8BG15 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctdspl2Q8BG15 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctdspl2Q8BG15 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctdspl2Q8BG15 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctdspl2Q8BG15 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctdspl2Q8BG15 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctdspl2Q8BG15 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctdspl2Q8BG15 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctdspl2Q8BG15 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctdspl2Q8BG15 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctdspl2Q8BG15 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctdspl2Q8BG15 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctdspl2Q8BG15 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctdspl2Q8BG15 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctdspl2Q8BG15 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctdspl2Q8BG15 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctdspl2Q8BG15 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctdspl2Q8BG15 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctdspl2Q8BG15 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctdspl2Q8BG15 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctdspl2Q8BG15 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctdspl2Q8BG15 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctdspl2Q8BG15 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctdspl2Q8BG15 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctdspl2Q8BG15 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctdspl2Q8BG15 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctdspl2Q8BG15 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctdspl2Q8BG15 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctdspl2Q8BG15 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctdspl2Q8BG15 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctdspl2Q8BG15 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctdspl2Q8BG15 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctdspl2Q8BG15 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctdspl2Q8BG15 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctdspl2Q8BG15 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctdspl2Q8BG15 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctdspl2Q8BG15 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctdspl2Q8BG15 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctdspl2Q8BG15 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctdspl2Q8BG15 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctdspl2Q8BG15 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctdspl2Q8BG15 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctdspl2Q8BG15 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctdspl2Q8BG15 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctdspl2Q8BG15 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctdspl2Q8BG15 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctdspl2Q8BG15 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctdspl2Q8BG15 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctdspl2Q8BG15 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctdspl2Q8BG15 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctdspl2Q8BG15 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctdspl2Q8BG15 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctdspl2Q8BG15 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctdspl2Q8BG15 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctdspl2Q8BG15 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctdspl2Q8BG15 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctdspl2Q8BG15 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctdspl2Q8BG15 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctdspl2Q8BG15 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctdspl2Q8BG15 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctdspl2Q8BG15 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctdspl2Q8BG15 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctdspl2Q8BG15 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctdspl2Q8BG15 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctdspl2Q8BG15 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms