Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW6

H2-M10.3, Histocompatibility 2, M region locus 10.3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.3Q85ZW6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
H2-M10.3Q85ZW6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
H2-M10.3Q85ZW6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
H2-M10.3Q85ZW6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-M10.3Q85ZW6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-M10.3Q85ZW6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-M10.3Q85ZW6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-M10.3Q85ZW6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-M10.3Q85ZW6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-M10.3Q85ZW6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-M10.3Q85ZW6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-M10.3Q85ZW6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-M10.3Q85ZW6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-M10.3Q85ZW6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-M10.3Q85ZW6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-M10.3Q85ZW6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-M10.3Q85ZW6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-M10.3Q85ZW6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-M10.3Q85ZW6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-M10.3Q85ZW6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-M10.3Q85ZW6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-M10.3Q85ZW6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-M10.3Q85ZW6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-M10.3Q85ZW6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-M10.3Q85ZW6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-M10.3Q85ZW6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-M10.3Q85ZW6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-M10.3Q85ZW6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-M10.3Q85ZW6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-M10.3Q85ZW6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-M10.3Q85ZW6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-M10.3Q85ZW6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-M10.3Q85ZW6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-M10.3Q85ZW6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-M10.3Q85ZW6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-M10.3Q85ZW6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-M10.3Q85ZW6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-M10.3Q85ZW6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-M10.3Q85ZW6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-M10.3Q85ZW6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-M10.3Q85ZW6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-M10.3Q85ZW6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-M10.3Q85ZW6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-M10.3Q85ZW6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-M10.3Q85ZW6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-M10.3Q85ZW6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-M10.3Q85ZW6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-M10.3Q85ZW6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-M10.3Q85ZW6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-M10.3Q85ZW6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-M10.3Q85ZW6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-M10.3Q85ZW6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-M10.3Q85ZW6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-M10.3Q85ZW6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-M10.3Q85ZW6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-M10.3Q85ZW6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-M10.3Q85ZW6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-M10.3Q85ZW6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-M10.3Q85ZW6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-M10.3Q85ZW6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-M10.3Q85ZW6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-M10.3Q85ZW6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-M10.3Q85ZW6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-M10.3Q85ZW6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-M10.3Q85ZW6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M10.3Q85ZW6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M10.3Q85ZW6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M10.3Q85ZW6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M10.3Q85ZW6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M10.3Q85ZW6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M10.3Q85ZW6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M10.3Q85ZW6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M10.3Q85ZW6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M10.3Q85ZW6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M10.3Q85ZW6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M10.3Q85ZW6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M10.3Q85ZW6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M10.3Q85ZW6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M10.3Q85ZW6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M10.3Q85ZW6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-M10.3Q85ZW6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-M10.3Q85ZW6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-M10.3Q85ZW6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-M10.3Q85ZW6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-M10.3Q85ZW6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
H2-M10.3Q85ZW6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
H2-M10.3Q85ZW6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
H2-M10.3Q85ZW6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
H2-M10.3Q85ZW6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
H2-M10.3Q85ZW6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
H2-M10.3Q85ZW6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
H2-M10.3Q85ZW6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-M10.3Q85ZW6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-M10.3Q85ZW6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-M10.3Q85ZW6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-M10.3Q85ZW6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-M10.3Q85ZW6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-M10.3Q85ZW6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-M10.3Q85ZW6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-M10.3Q85ZW6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms