Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

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Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg4cQ811C2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg4cQ811C2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg4cQ811C2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg4cQ811C2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg4cQ811C2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg4cQ811C2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg4cQ811C2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg4cQ811C2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg4cQ811C2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg4cQ811C2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg4cQ811C2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg4cQ811C2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg4cQ811C2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg4cQ811C2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg4cQ811C2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg4cQ811C2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg4cQ811C2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg4cQ811C2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg4cQ811C2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg4cQ811C2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg4cQ811C2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg4cQ811C2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg4cQ811C2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg4cQ811C2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg4cQ811C2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg4cQ811C2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg4cQ811C2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg4cQ811C2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
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Atg4cQ811C2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
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Atg4cQ811C2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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Atg4cQ811C2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg4cQ811C2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg4cQ811C2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg4cQ811C2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg4cQ811C2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg4cQ811C2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg4cQ811C2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atg4cQ811C2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atg4cQ811C2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atg4cQ811C2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atg4cQ811C2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atg4cQ811C2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Atg4cQ811C2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Atg4cQ811C2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atg4cQ811C2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Atg4cQ811C2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atg4cQ811C2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atg4cQ811C2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Atg4cQ811C2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atg4cQ811C2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atg4cQ811C2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atg4cQ811C2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atg4cQ811C2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atg4cQ811C2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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Atg4cQ811C2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atg4cQ811C2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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Atg4cQ811C2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atg4cQ811C2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atg4cQ811C2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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Atg4cQ811C2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atg4cQ811C2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atg4cQ811C2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atg4cQ811C2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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Atg4cQ811C2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atg4cQ811C2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atg4cQ811C2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atg4cQ811C2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atg4cQ811C2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atg4cQ811C2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atg4cQ811C2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atg4cQ811C2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atg4cQ811C2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atg4cQ811C2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atg4cQ811C2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atg4cQ811C2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atg4cQ811C2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atg4cQ811C2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atg4cQ811C2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atg4cQ811C2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atg4cQ811C2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atg4cQ811C2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atg4cQ811C2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atg4cQ811C2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Atg4cQ811C2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atg4cQ811C2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atg4cQ811C2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
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