Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc50Q810U5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc50Q810U5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc50Q810U5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms