Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc172Q810N9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc172Q810N9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc172Q810N9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc172Q810N9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc172Q810N9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc172Q810N9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc172Q810N9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc172Q810N9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc172Q810N9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc172Q810N9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc172Q810N9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc172Q810N9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc172Q810N9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc172Q810N9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc172Q810N9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc172Q810N9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc172Q810N9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc172Q810N9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc172Q810N9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc172Q810N9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc172Q810N9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc172Q810N9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc172Q810N9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc172Q810N9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc172Q810N9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc172Q810N9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc172Q810N9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc172Q810N9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc172Q810N9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc172Q810N9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc172Q810N9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc172Q810N9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc172Q810N9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc172Q810N9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc172Q810N9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc172Q810N9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc172Q810N9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc172Q810N9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc172Q810N9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc172Q810N9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc172Q810N9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc172Q810N9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc172Q810N9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc172Q810N9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc172Q810N9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc172Q810N9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc172Q810N9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc172Q810N9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc172Q810N9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc172Q810N9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc172Q810N9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc172Q810N9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc172Q810N9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc172Q810N9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc172Q810N9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc172Q810N9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc172Q810N9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc172Q810N9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc172Q810N9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc172Q810N9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc172Q810N9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc172Q810N9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc172Q810N9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc172Q810N9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc172Q810N9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc172Q810N9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.1 ms