Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc28Q80XJ3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc28Q80XJ3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc28Q80XJ3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc28Q80XJ3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc28Q80XJ3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc28Q80XJ3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc28Q80XJ3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc28Q80XJ3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc28Q80XJ3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc28Q80XJ3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc28Q80XJ3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc28Q80XJ3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc28Q80XJ3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc28Q80XJ3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc28Q80XJ3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc28Q80XJ3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc28Q80XJ3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc28Q80XJ3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc28Q80XJ3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc28Q80XJ3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc28Q80XJ3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc28Q80XJ3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc28Q80XJ3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc28Q80XJ3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc28Q80XJ3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc28Q80XJ3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Ttc28Q80XJ3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc28Q80XJ3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc28Q80XJ3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc28Q80XJ3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc28Q80XJ3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc28Q80XJ3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc28Q80XJ3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc28Q80XJ3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc28Q80XJ3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc28Q80XJ3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc28Q80XJ3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc28Q80XJ3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc28Q80XJ3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc28Q80XJ3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc28Q80XJ3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc28Q80XJ3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc28Q80XJ3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Ttc28Q80XJ3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc28Q80XJ3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc28Q80XJ3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc28Q80XJ3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc28Q80XJ3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc28Q80XJ3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc28Q80XJ3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc28Q80XJ3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc28Q80XJ3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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Ttc28Q80XJ3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc28Q80XJ3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc28Q80XJ3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc28Q80XJ3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc28Q80XJ3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Ttc28Q80XJ3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Ttc28Q80XJ3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc28Q80XJ3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ttc28Q80XJ3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc28Q80XJ3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc28Q80XJ3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc28Q80XJ3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc28Q80XJ3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc28Q80XJ3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc28Q80XJ3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc28Q80XJ3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc28Q80XJ3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc28Q80XJ3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc28Q80XJ3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc28Q80XJ3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc28Q80XJ3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc28Q80XJ3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc28Q80XJ3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc28Q80XJ3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc28Q80XJ3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc28Q80XJ3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc28Q80XJ3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc28Q80XJ3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc28Q80XJ3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc28Q80XJ3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc28Q80XJ3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc28Q80XJ3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc28Q80XJ3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc28Q80XJ3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc28Q80XJ3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc28Q80XJ3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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