Protein–RNA interactions for Protein: Q80UN1

Kctd9, BTB/POZ domain-containing protein KCTD9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kctd9Q80UN1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kctd9Q80UN1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kctd9Q80UN1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kctd9Q80UN1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kctd9Q80UN1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kctd9Q80UN1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kctd9Q80UN1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kctd9Q80UN1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kctd9Q80UN1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Kctd9Q80UN1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kctd9Q80UN1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kctd9Q80UN1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kctd9Q80UN1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kctd9Q80UN1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kctd9Q80UN1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Kctd9Q80UN1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kctd9Q80UN1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Kctd9Q80UN1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kctd9Q80UN1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kctd9Q80UN1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kctd9Q80UN1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kctd9Q80UN1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kctd9Q80UN1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kctd9Q80UN1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kctd9Q80UN1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kctd9Q80UN1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kctd9Q80UN1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kctd9Q80UN1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kctd9Q80UN1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kctd9Q80UN1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kctd9Q80UN1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kctd9Q80UN1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kctd9Q80UN1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kctd9Q80UN1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Kctd9Q80UN1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kctd9Q80UN1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kctd9Q80UN1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kctd9Q80UN1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kctd9Q80UN1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kctd9Q80UN1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kctd9Q80UN1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kctd9Q80UN1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kctd9Q80UN1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kctd9Q80UN1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kctd9Q80UN1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kctd9Q80UN1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kctd9Q80UN1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kctd9Q80UN1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kctd9Q80UN1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kctd9Q80UN1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kctd9Q80UN1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kctd9Q80UN1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kctd9Q80UN1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kctd9Q80UN1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kctd9Q80UN1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kctd9Q80UN1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kctd9Q80UN1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kctd9Q80UN1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kctd9Q80UN1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kctd9Q80UN1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kctd9Q80UN1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kctd9Q80UN1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kctd9Q80UN1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kctd9Q80UN1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kctd9Q80UN1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kctd9Q80UN1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kctd9Q80UN1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kctd9Q80UN1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kctd9Q80UN1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kctd9Q80UN1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kctd9Q80UN1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kctd9Q80UN1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kctd9Q80UN1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kctd9Q80UN1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kctd9Q80UN1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kctd9Q80UN1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kctd9Q80UN1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kctd9Q80UN1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kctd9Q80UN1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kctd9Q80UN1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kctd9Q80UN1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kctd9Q80UN1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kctd9Q80UN1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kctd9Q80UN1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kctd9Q80UN1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kctd9Q80UN1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kctd9Q80UN1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kctd9Q80UN1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kctd9Q80UN1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kctd9Q80UN1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kctd9Q80UN1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kctd9Q80UN1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kctd9Q80UN1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kctd9Q80UN1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kctd9Q80UN1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kctd9Q80UN1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kctd9Q80UN1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Kctd9Q80UN1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Kctd9Q80UN1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121 ms