Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctdp1Q7TSG2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctdp1Q7TSG2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctdp1Q7TSG2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctdp1Q7TSG2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctdp1Q7TSG2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctdp1Q7TSG2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctdp1Q7TSG2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctdp1Q7TSG2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctdp1Q7TSG2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctdp1Q7TSG2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ctdp1Q7TSG2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ctdp1Q7TSG2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms