Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ33

Rgmb, RGM domain family member B, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RgmbQ7TQ33 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RgmbQ7TQ33 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RgmbQ7TQ33 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RgmbQ7TQ33 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RgmbQ7TQ33 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RgmbQ7TQ33 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RgmbQ7TQ33 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RgmbQ7TQ33 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RgmbQ7TQ33 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RgmbQ7TQ33 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RgmbQ7TQ33 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RgmbQ7TQ33 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RgmbQ7TQ33 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RgmbQ7TQ33 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RgmbQ7TQ33 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RgmbQ7TQ33 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RgmbQ7TQ33 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RgmbQ7TQ33 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RgmbQ7TQ33 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RgmbQ7TQ33 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RgmbQ7TQ33 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RgmbQ7TQ33 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RgmbQ7TQ33 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RgmbQ7TQ33 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RgmbQ7TQ33 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RgmbQ7TQ33 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RgmbQ7TQ33 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RgmbQ7TQ33 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RgmbQ7TQ33 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RgmbQ7TQ33 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RgmbQ7TQ33 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RgmbQ7TQ33 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RgmbQ7TQ33 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RgmbQ7TQ33 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RgmbQ7TQ33 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RgmbQ7TQ33 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RgmbQ7TQ33 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RgmbQ7TQ33 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RgmbQ7TQ33 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RgmbQ7TQ33 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RgmbQ7TQ33 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RgmbQ7TQ33 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RgmbQ7TQ33 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RgmbQ7TQ33 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RgmbQ7TQ33 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RgmbQ7TQ33 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RgmbQ7TQ33 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RgmbQ7TQ33 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RgmbQ7TQ33 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RgmbQ7TQ33 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RgmbQ7TQ33 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RgmbQ7TQ33 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RgmbQ7TQ33 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RgmbQ7TQ33 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RgmbQ7TQ33 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RgmbQ7TQ33 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RgmbQ7TQ33 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RgmbQ7TQ33 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RgmbQ7TQ33 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RgmbQ7TQ33 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RgmbQ7TQ33 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RgmbQ7TQ33 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RgmbQ7TQ33 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RgmbQ7TQ33 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RgmbQ7TQ33 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RgmbQ7TQ33 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RgmbQ7TQ33 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RgmbQ7TQ33 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RgmbQ7TQ33 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RgmbQ7TQ33 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RgmbQ7TQ33 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RgmbQ7TQ33 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RgmbQ7TQ33 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RgmbQ7TQ33 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RgmbQ7TQ33 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RgmbQ7TQ33 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RgmbQ7TQ33 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RgmbQ7TQ33 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RgmbQ7TQ33 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RgmbQ7TQ33 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RgmbQ7TQ33 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RgmbQ7TQ33 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RgmbQ7TQ33 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RgmbQ7TQ33 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RgmbQ7TQ33 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RgmbQ7TQ33 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RgmbQ7TQ33 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RgmbQ7TQ33 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RgmbQ7TQ33 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RgmbQ7TQ33 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RgmbQ7TQ33 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RgmbQ7TQ33 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RgmbQ7TQ33 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RgmbQ7TQ33 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RgmbQ7TQ33 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RgmbQ7TQ33 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RgmbQ7TQ33 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RgmbQ7TQ33 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RgmbQ7TQ33 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RgmbQ7TQ33 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms