Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPH6

Mycbp2, E3 ubiquitin-protein ligase MYCBP2, mousemouse

Predictions only

Length 4,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mycbp2Q7TPH6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mycbp2Q7TPH6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Mycbp2Q7TPH6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mycbp2Q7TPH6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mycbp2Q7TPH6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mycbp2Q7TPH6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mycbp2Q7TPH6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mycbp2Q7TPH6 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mycbp2Q7TPH6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mycbp2Q7TPH6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mycbp2Q7TPH6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mycbp2Q7TPH6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mycbp2Q7TPH6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mycbp2Q7TPH6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mycbp2Q7TPH6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mycbp2Q7TPH6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mycbp2Q7TPH6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mycbp2Q7TPH6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mycbp2Q7TPH6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mycbp2Q7TPH6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mycbp2Q7TPH6 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Mycbp2Q7TPH6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Mycbp2Q7TPH6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mycbp2Q7TPH6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms