Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMV1

Rnf139, E3 ubiquitin-protein ligase RNF139, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf139Q7TMV1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf139Q7TMV1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf139Q7TMV1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf139Q7TMV1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf139Q7TMV1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf139Q7TMV1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf139Q7TMV1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf139Q7TMV1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf139Q7TMV1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf139Q7TMV1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf139Q7TMV1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf139Q7TMV1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf139Q7TMV1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf139Q7TMV1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf139Q7TMV1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf139Q7TMV1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf139Q7TMV1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf139Q7TMV1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf139Q7TMV1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf139Q7TMV1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf139Q7TMV1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf139Q7TMV1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf139Q7TMV1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf139Q7TMV1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf139Q7TMV1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf139Q7TMV1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rnf139Q7TMV1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Rnf139Q7TMV1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rnf139Q7TMV1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf139Q7TMV1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf139Q7TMV1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf139Q7TMV1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf139Q7TMV1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf139Q7TMV1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf139Q7TMV1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf139Q7TMV1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf139Q7TMV1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf139Q7TMV1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf139Q7TMV1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf139Q7TMV1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf139Q7TMV1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf139Q7TMV1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf139Q7TMV1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf139Q7TMV1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf139Q7TMV1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf139Q7TMV1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf139Q7TMV1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf139Q7TMV1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf139Q7TMV1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf139Q7TMV1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf139Q7TMV1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf139Q7TMV1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf139Q7TMV1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf139Q7TMV1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf139Q7TMV1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf139Q7TMV1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf139Q7TMV1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf139Q7TMV1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf139Q7TMV1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf139Q7TMV1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf139Q7TMV1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf139Q7TMV1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf139Q7TMV1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf139Q7TMV1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf139Q7TMV1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf139Q7TMV1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf139Q7TMV1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf139Q7TMV1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf139Q7TMV1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf139Q7TMV1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf139Q7TMV1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf139Q7TMV1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf139Q7TMV1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf139Q7TMV1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf139Q7TMV1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf139Q7TMV1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf139Q7TMV1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf139Q7TMV1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf139Q7TMV1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf139Q7TMV1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf139Q7TMV1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf139Q7TMV1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf139Q7TMV1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf139Q7TMV1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf139Q7TMV1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf139Q7TMV1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf139Q7TMV1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf139Q7TMV1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf139Q7TMV1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf139Q7TMV1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf139Q7TMV1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf139Q7TMV1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf139Q7TMV1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf139Q7TMV1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf139Q7TMV1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf139Q7TMV1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf139Q7TMV1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf139Q7TMV1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf139Q7TMV1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnf139Q7TMV1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms