Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smim12Q78RX3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim12Q78RX3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms