Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Higd1cQ76I25 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Higd1cQ76I25 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms