Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWZ2

Ube2r2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2r2Q6ZWZ2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ube2r2Q6ZWZ2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms