Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWY6

Ube2d2b, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2B, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d2bQ6ZWY6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms