Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SpopQ6ZWS8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SpopQ6ZWS8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SpopQ6ZWS8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SpopQ6ZWS8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SpopQ6ZWS8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SpopQ6ZWS8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SpopQ6ZWS8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SpopQ6ZWS8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SpopQ6ZWS8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SpopQ6ZWS8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SpopQ6ZWS8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SpopQ6ZWS8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SpopQ6ZWS8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SpopQ6ZWS8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SpopQ6ZWS8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SpopQ6ZWS8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SpopQ6ZWS8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SpopQ6ZWS8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SpopQ6ZWS8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SpopQ6ZWS8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SpopQ6ZWS8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SpopQ6ZWS8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SpopQ6ZWS8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SpopQ6ZWS8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SpopQ6ZWS8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SpopQ6ZWS8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SpopQ6ZWS8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SpopQ6ZWS8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SpopQ6ZWS8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SpopQ6ZWS8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SpopQ6ZWS8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SpopQ6ZWS8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SpopQ6ZWS8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SpopQ6ZWS8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SpopQ6ZWS8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SpopQ6ZWS8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SpopQ6ZWS8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SpopQ6ZWS8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SpopQ6ZWS8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SpopQ6ZWS8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SpopQ6ZWS8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SpopQ6ZWS8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SpopQ6ZWS8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SpopQ6ZWS8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SpopQ6ZWS8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SpopQ6ZWS8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SpopQ6ZWS8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SpopQ6ZWS8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SpopQ6ZWS8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SpopQ6ZWS8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SpopQ6ZWS8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SpopQ6ZWS8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SpopQ6ZWS8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SpopQ6ZWS8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SpopQ6ZWS8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SpopQ6ZWS8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SpopQ6ZWS8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SpopQ6ZWS8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SpopQ6ZWS8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SpopQ6ZWS8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SpopQ6ZWS8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SpopQ6ZWS8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SpopQ6ZWS8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SpopQ6ZWS8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SpopQ6ZWS8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SpopQ6ZWS8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SpopQ6ZWS8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SpopQ6ZWS8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SpopQ6ZWS8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SpopQ6ZWS8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SpopQ6ZWS8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SpopQ6ZWS8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SpopQ6ZWS8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SpopQ6ZWS8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SpopQ6ZWS8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SpopQ6ZWS8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SpopQ6ZWS8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SpopQ6ZWS8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SpopQ6ZWS8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SpopQ6ZWS8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SpopQ6ZWS8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SpopQ6ZWS8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SpopQ6ZWS8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SpopQ6ZWS8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SpopQ6ZWS8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SpopQ6ZWS8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SpopQ6ZWS8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SpopQ6ZWS8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SpopQ6ZWS8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SpopQ6ZWS8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SpopQ6ZWS8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SpopQ6ZWS8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SpopQ6ZWS8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SpopQ6ZWS8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SpopQ6ZWS8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SpopQ6ZWS8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SpopQ6ZWS8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SpopQ6ZWS8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SpopQ6ZWS8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms