Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQH8

Nup188, Nucleoporin NUP188 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup188Q6ZQH8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup188Q6ZQH8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nup188Q6ZQH8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nup188Q6ZQH8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nup188Q6ZQH8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nup188Q6ZQH8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nup188Q6ZQH8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nup188Q6ZQH8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nup188Q6ZQH8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup188Q6ZQH8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup188Q6ZQH8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup188Q6ZQH8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup188Q6ZQH8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup188Q6ZQH8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup188Q6ZQH8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup188Q6ZQH8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup188Q6ZQH8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup188Q6ZQH8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup188Q6ZQH8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup188Q6ZQH8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup188Q6ZQH8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup188Q6ZQH8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup188Q6ZQH8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup188Q6ZQH8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup188Q6ZQH8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup188Q6ZQH8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup188Q6ZQH8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup188Q6ZQH8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup188Q6ZQH8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup188Q6ZQH8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup188Q6ZQH8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup188Q6ZQH8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup188Q6ZQH8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup188Q6ZQH8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nup188Q6ZQH8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nup188Q6ZQH8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nup188Q6ZQH8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Nup188Q6ZQH8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nup188Q6ZQH8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nup188Q6ZQH8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nup188Q6ZQH8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nup188Q6ZQH8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nup188Q6ZQH8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nup188Q6ZQH8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nup188Q6ZQH8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nup188Q6ZQH8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nup188Q6ZQH8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nup188Q6ZQH8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nup188Q6ZQH8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nup188Q6ZQH8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nup188Q6ZQH8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nup188Q6ZQH8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Nup188Q6ZQH8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nup188Q6ZQH8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nup188Q6ZQH8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nup188Q6ZQH8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nup188Q6ZQH8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nup188Q6ZQH8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nup188Q6ZQH8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nup188Q6ZQH8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Nup188Q6ZQH8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nup188Q6ZQH8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Nup188Q6ZQH8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nup188Q6ZQH8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nup188Q6ZQH8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nup188Q6ZQH8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nup188Q6ZQH8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nup188Q6ZQH8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nup188Q6ZQH8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nup188Q6ZQH8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nup188Q6ZQH8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nup188Q6ZQH8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nup188Q6ZQH8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nup188Q6ZQH8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nup188Q6ZQH8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nup188Q6ZQH8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nup188Q6ZQH8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nup188Q6ZQH8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nup188Q6ZQH8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nup188Q6ZQH8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nup188Q6ZQH8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nup188Q6ZQH8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nup188Q6ZQH8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nup188Q6ZQH8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nup188Q6ZQH8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nup188Q6ZQH8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nup188Q6ZQH8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nup188Q6ZQH8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nup188Q6ZQH8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nup188Q6ZQH8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nup188Q6ZQH8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nup188Q6ZQH8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nup188Q6ZQH8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nup188Q6ZQH8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nup188Q6ZQH8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup188Q6ZQH8 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup188Q6ZQH8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup188Q6ZQH8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup188Q6ZQH8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup188Q6ZQH8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms