Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Topbp1Q6ZQF0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Topbp1Q6ZQF0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Topbp1Q6ZQF0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Topbp1Q6ZQF0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Topbp1Q6ZQF0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Topbp1Q6ZQF0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Topbp1Q6ZQF0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Topbp1Q6ZQF0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Topbp1Q6ZQF0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Topbp1Q6ZQF0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Topbp1Q6ZQF0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Topbp1Q6ZQF0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Topbp1Q6ZQF0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Topbp1Q6ZQF0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Topbp1Q6ZQF0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Topbp1Q6ZQF0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Topbp1Q6ZQF0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Topbp1Q6ZQF0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Topbp1Q6ZQF0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Topbp1Q6ZQF0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Topbp1Q6ZQF0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Topbp1Q6ZQF0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Topbp1Q6ZQF0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Topbp1Q6ZQF0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Topbp1Q6ZQF0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Topbp1Q6ZQF0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Topbp1Q6ZQF0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Topbp1Q6ZQF0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Topbp1Q6ZQF0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Topbp1Q6ZQF0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Topbp1Q6ZQF0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Topbp1Q6ZQF0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Topbp1Q6ZQF0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Topbp1Q6ZQF0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Topbp1Q6ZQF0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Topbp1Q6ZQF0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Topbp1Q6ZQF0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Topbp1Q6ZQF0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Topbp1Q6ZQF0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Topbp1Q6ZQF0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Topbp1Q6ZQF0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Topbp1Q6ZQF0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Topbp1Q6ZQF0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Topbp1Q6ZQF0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Topbp1Q6ZQF0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Topbp1Q6ZQF0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Topbp1Q6ZQF0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Topbp1Q6ZQF0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Topbp1Q6ZQF0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Topbp1Q6ZQF0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Topbp1Q6ZQF0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Topbp1Q6ZQF0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Topbp1Q6ZQF0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Topbp1Q6ZQF0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Topbp1Q6ZQF0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Topbp1Q6ZQF0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Topbp1Q6ZQF0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Topbp1Q6ZQF0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Topbp1Q6ZQF0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Topbp1Q6ZQF0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Topbp1Q6ZQF0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Topbp1Q6ZQF0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Topbp1Q6ZQF0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Topbp1Q6ZQF0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Topbp1Q6ZQF0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Topbp1Q6ZQF0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Topbp1Q6ZQF0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Topbp1Q6ZQF0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Topbp1Q6ZQF0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Topbp1Q6ZQF0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Topbp1Q6ZQF0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Topbp1Q6ZQF0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Topbp1Q6ZQF0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Topbp1Q6ZQF0 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Topbp1Q6ZQF0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Topbp1Q6ZQF0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Topbp1Q6ZQF0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Topbp1Q6ZQF0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Topbp1Q6ZQF0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Topbp1Q6ZQF0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Topbp1Q6ZQF0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Topbp1Q6ZQF0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Topbp1Q6ZQF0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Topbp1Q6ZQF0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Topbp1Q6ZQF0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Topbp1Q6ZQF0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Topbp1Q6ZQF0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Topbp1Q6ZQF0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Topbp1Q6ZQF0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Topbp1Q6ZQF0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Topbp1Q6ZQF0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Topbp1Q6ZQF0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Topbp1Q6ZQF0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Topbp1Q6ZQF0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Topbp1Q6ZQF0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Topbp1Q6ZQF0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Topbp1Q6ZQF0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Topbp1Q6ZQF0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms