Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQE4

Nemp1, Nuclear envelope integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nemp1Q6ZQE4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nemp1Q6ZQE4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nemp1Q6ZQE4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nemp1Q6ZQE4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nemp1Q6ZQE4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nemp1Q6ZQE4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nemp1Q6ZQE4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nemp1Q6ZQE4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nemp1Q6ZQE4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nemp1Q6ZQE4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nemp1Q6ZQE4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nemp1Q6ZQE4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nemp1Q6ZQE4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nemp1Q6ZQE4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nemp1Q6ZQE4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nemp1Q6ZQE4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nemp1Q6ZQE4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nemp1Q6ZQE4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nemp1Q6ZQE4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nemp1Q6ZQE4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nemp1Q6ZQE4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nemp1Q6ZQE4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nemp1Q6ZQE4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nemp1Q6ZQE4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nemp1Q6ZQE4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nemp1Q6ZQE4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nemp1Q6ZQE4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nemp1Q6ZQE4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nemp1Q6ZQE4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nemp1Q6ZQE4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nemp1Q6ZQE4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nemp1Q6ZQE4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nemp1Q6ZQE4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nemp1Q6ZQE4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nemp1Q6ZQE4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nemp1Q6ZQE4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nemp1Q6ZQE4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nemp1Q6ZQE4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nemp1Q6ZQE4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nemp1Q6ZQE4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms