Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPJ3

Ube2o, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme UBE2O, mousemouse

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2oQ6ZPJ3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ube2oQ6ZPJ3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ube2oQ6ZPJ3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ube2oQ6ZPJ3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ube2oQ6ZPJ3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ube2oQ6ZPJ3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ube2oQ6ZPJ3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ube2oQ6ZPJ3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ube2oQ6ZPJ3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ube2oQ6ZPJ3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ube2oQ6ZPJ3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ube2oQ6ZPJ3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ube2oQ6ZPJ3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ube2oQ6ZPJ3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ube2oQ6ZPJ3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ube2oQ6ZPJ3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ube2oQ6ZPJ3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ube2oQ6ZPJ3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ube2oQ6ZPJ3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ube2oQ6ZPJ3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ube2oQ6ZPJ3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ube2oQ6ZPJ3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ube2oQ6ZPJ3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ube2oQ6ZPJ3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ube2oQ6ZPJ3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ube2oQ6ZPJ3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ube2oQ6ZPJ3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ube2oQ6ZPJ3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ube2oQ6ZPJ3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ube2oQ6ZPJ3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ube2oQ6ZPJ3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ube2oQ6ZPJ3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ube2oQ6ZPJ3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ube2oQ6ZPJ3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ube2oQ6ZPJ3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube2oQ6ZPJ3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube2oQ6ZPJ3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube2oQ6ZPJ3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube2oQ6ZPJ3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube2oQ6ZPJ3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube2oQ6ZPJ3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube2oQ6ZPJ3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube2oQ6ZPJ3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube2oQ6ZPJ3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube2oQ6ZPJ3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube2oQ6ZPJ3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube2oQ6ZPJ3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube2oQ6ZPJ3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube2oQ6ZPJ3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube2oQ6ZPJ3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube2oQ6ZPJ3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube2oQ6ZPJ3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube2oQ6ZPJ3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ube2oQ6ZPJ3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ube2oQ6ZPJ3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ube2oQ6ZPJ3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ube2oQ6ZPJ3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ube2oQ6ZPJ3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ube2oQ6ZPJ3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ube2oQ6ZPJ3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ube2oQ6ZPJ3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ube2oQ6ZPJ3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ube2oQ6ZPJ3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ube2oQ6ZPJ3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ube2oQ6ZPJ3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ube2oQ6ZPJ3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ube2oQ6ZPJ3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ube2oQ6ZPJ3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ube2oQ6ZPJ3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ube2oQ6ZPJ3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ube2oQ6ZPJ3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ube2oQ6ZPJ3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ube2oQ6ZPJ3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ube2oQ6ZPJ3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ube2oQ6ZPJ3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ube2oQ6ZPJ3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ube2oQ6ZPJ3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ube2oQ6ZPJ3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ube2oQ6ZPJ3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ube2oQ6ZPJ3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ube2oQ6ZPJ3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ube2oQ6ZPJ3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ube2oQ6ZPJ3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ube2oQ6ZPJ3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ube2oQ6ZPJ3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ube2oQ6ZPJ3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ube2oQ6ZPJ3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ube2oQ6ZPJ3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ube2oQ6ZPJ3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ube2oQ6ZPJ3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ube2oQ6ZPJ3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ube2oQ6ZPJ3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ube2oQ6ZPJ3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ube2oQ6ZPJ3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ube2oQ6ZPJ3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ube2oQ6ZPJ3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ube2oQ6ZPJ3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ube2oQ6ZPJ3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ube2oQ6ZPJ3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ube2oQ6ZPJ3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms